A Diocese de Bom Jesus da Lapa foi criada pela Bula Pontifícia “Christi Eclésia”, de 21 de julho de 1962, e instalada no dia 16 de fevereiro de 1963. Para efeitos civis, ela é regulada pelas disposições contidas no Estatuto, sob a denominação de Mitra Diocesana de Bom Jesus da Lapa. Foi seu primeiro Bispo Diocesano D. José Nicomedes Grossi, padre da arquidiocese de Mariana, que governou a diocese por 27 anos. Iniciou a organização da Diocese, enfrentando os grandes desafios dos inícios e da implantação de uma nova circunscrição eclesial. Faleceu em junho de 2009. Foi seu Bispo Coadjuntor, por dois anos (1986 a 1988), D. João Nilton dos Santos Souza. O segundo Bispo Diocesano foi Dom Francisco Batistela (1990-2009), religioso da Congregação do Santíssimo Redentor. Governou a Diocese por 19 anos, dando sua contribuição no crescimento e desenvolvimento dos trabalhos evangelizadores e pastorais. Faleceu em outubro de 2010.
O terceiro Bispo Diocesano, Dom José Valmor César Teixeira, Salesiano de Dom Bosco, iniciou seu trabalho pastoral na diocese em abril de 2009, dando continuidade aos esforços realizados pelos agentes de pastoral, bispos, padres, religiosos, religiosas e leigos(as), que construíram a Diocese nestes anos todos. Foi transferido para diocese de São José dos Campos, tomando posse em 17 de abril de 2014. Ficou cinco anos na Diocese de Bom Jesus da Lapa. Em 21 de maio de 2014 toma posse como Bispo Administrador Apostólico, Dom Josafá Menezes da Silva, Bispo Diocesano da Diocese de Barreiras, BA, até a tomada de posse do quarto bispo da Diocese, Dom João Santos Cardoso, em 25 de setembro de 2015. A Diocese conta com 18 Paróquias e o Santuário do Bom Jesus da Lapa. A Diocese de Bom Jesus da Lapa compreende 15 municípios do Sudoeste e do Oeste da Bahia, fazendo fronteira com os estados de Goiás e Minas Gerais; ocupa um território de 56.880,43 Km2 e tem uma população de 376.715 habitantes. A atividade econômica principal da região é a agricultura familiar e a pecuária de grande extensão. Nos últimos anos, em três municípios da Diocese, tem avançado o agronegócio, assentado na agricultura extensiva de alta tecnologia e irrigada, destinada à produção de grãos.